Иван Грозный нас барсны дараа "харьяалалгүй" үед өвчтэй, сул дорой Федортой хамт боярууд эрх мэдлийн төлөө нээлттэй тэмцэл хийж эхлэв. Тэдний хамгийн хүчтэй нь хуучин опричник Годунов байв. Теодорыг нас барсны дараа Патриарх Иов шинэ эзэн хааныг сонгохоор Земский Соборыг цуглуулав. Энэхүү сүмд Патриархын зөвлөл, Боярын Дум, үйлчилгээний ажилтнууд, Москвагийн худалдаа, аж үйлдвэрийн хүн амын төлөөлөгчид цугларав. Хамгийн их магадлалтай хоёр хүн: хааны хүргэн ах Борис Федорович Годунов, Цар Федорын үеэл, Никита Романовичийн ууган хүү Федор Никитич Романов нар байв.
Борис Годуновын засаглалын он жилүүд Оросын төрийн түүхэнд хүнд хэцүү цаг үед тохиосон. Энэ бол 1598-1605 он хүртэлх үе юм. Үнэн хэрэгтээ ирээдүйн хаан Грозный Иваны өвчтэй хүү Федорын дор аль хэдийн засгийн эрхэнд байсан.
Борис Годуновын хаанчлал хоёрдмол утгатай эхэлсэн. 1598 оны 2-р сард Зөвлөл Борисд хаан ширээг санал болгосон боловч тэрээр татгалзсан юм. Түүнийг зөвшөөрөхийн тулд Борис эгчтэйгээ хамт байсан Охины сүм рүү шашны жагсаал зохион байгуулав. Ирээдүйн хаан хаан ширээнд суухыг зөвшөөрөхөөс өөр аргагүй болжээ. Ийнхүү Годуновын сонгууль алдартай болсон. Гэсэн хэдий ч нэгэн зэрэгЭнэ зорилгодоо хүрэхийн тулд түүнийг нууцаар заналхийлж, хээл хахууль авдаг гэж үздэг байсан.
Борис зөвхөн 9-р сарын 1-нд хаант улстай гэрлэж, ард түмний сонгуулийн хүчтэй гэдэгт итгэлтэй байв. Борис Годуновын хаанчлал нь бүхэл бүтэн хугацаанд маш болгоомжтой байсан. Тэрээр өөрийн эрх мэдлийг оролдохоос айж, түүнийг сэжиглэж байсан бүх хөвгүүдийг устгасан. Түүний жинхэнэ өрсөлдөгч нь зөвхөн Федор Никитич Романов байсан бөгөөд үүний үр дүнд бүх Романовууд тусгаар тогтнолын эсрэг хуйвалдааны хэргээр шүүгджээ. Боярууд хаанд дургүй байсан тул түүнийг язгууртныг хавчиж хавчиж байсан аймшигт улсын залгамжлагч гэж үзэв.
Борис Годуновын хаанчлал бол Фёдорын бодлогын үргэлжлэл, эс тэгвээс Годуновын удирдлага дор хийсэн зүйл юм. Тэрээр Грозныйгийн эрин үед зөрчигдсөн хүмүүсийн сайн сайхан байдлыг сэргээхийг бүх арга замаар эрэлхийлэв. Гадаад бодлогын хувьд тэрээр мөргөлдөөнөөс зайлсхийх, шинэ дайн хийхээс зайлсхийхийг хичээсэн. Тэрээр шударга ёсыг бэхжүүлэхийн төлөө санаа тавьж, ард түмнийхээ төлөө сайн эзэн байхыг хүсдэг байв. Тэр үнэхээр жирийн ард түмэнд олон ашиг тусыг өгсөн. Гурван жил дараалан, 1601 оноос хойш газар тариалангийн дутагдалд орж, өлсгөлөнд нэрвэгдэж, үхэлд хүргэсэн. Борис хааны сангаас өлсгөлөнд нэрвэгдэгсдэд талх үнэгүй тараах ажлыг зохион байгуулж, нийслэлд томоохон барилгууд барьж, иргэдэд орлого оруулжээ.
Борис Годуновын хаанчлал өлсгөлөн, дээрэм дагалдаж байсан ч энэ нь түүний буруу биш байв. Гэсэн хэдий ч энэ нь хаанд дургүйцлийг нэмэгдүүлэхэд нөлөөлсөн. Өлсгөлөнгийн дараа хоёр дахь золгүй явдал тохиолдов - өөрийгөө тунхагласан Царевич Дмитрийгийн ард түмний бослого. Энэ тэмцлийн үеэр БорисГодунов гэнэтийн байдлаар нас барав (1605).
Годунов Европын боловсролд ихээхэн ач холбогдол өгсөн. Хаан технологи, анагаах ухааны салбарын гадаадын мэргэжилтнүүдтэй харилцаж, тэднийг төрийн албанд дуртайяа авав. Тэрээр залуучуудыг гадаад руу илгээж, Москвагийн сургуулиудыг гадаад хэлбэрээр зохион байгуулахаар төлөвлөж байв. Тэрээр гадаадын загварын дагуу германчуудын цэргийн отрядыг байгуулжээ. Годуновын үед Москвагийн засгийн газар гэгээрсэн барууны орнуудтай илүү ойр дотно харилцаатай байх, Европын мэдлэгийг өөртөө шингээх хүсэл эрмэлзэлтэй байсан нь илт байв.
Тиймээс Борис Годуновын хаанчлалыг ихэнх түүхчид товч дүрсэлсэн байдаг. Түүнийг хэрхэн хууль ёсны дагуу эрх мэдэлтэй болсон бэ гэдэгт олон хүн эргэлзэж, түүний гараар хийсэн бүтээл нь Аймшигт хааны бага хүү Дмитрий Царевичийг Углич хотод хөнөөсөн гэж үздэг.